发育畸形是否会影响精子质量，通常与畸形的部位有关，主要包括睾丸畸形、尿道畸形、鼻子畸形、唇腭裂，以及大脑异常等。

1、睾丸畸形：生殖器发育畸形中较为常见的是睾丸畸形，睾丸发育畸形可能会导致精子的生成障碍，会使精子的畸形率增加，影响精子质量;

2、尿道畸形：尿道畸形可能与遗传因素有关，也可能是先天发育异常导致，此时可能会影响精子质量，因为尿道畸形可能会导致精液在排出时受到阻碍，就可能会导致精子畸形率增加;

3、鼻子畸形：如果存在鼻子畸形，也会影响到精子质量，因为鼻腔畸形可能会使呼吸功能受到影响，就可能会导致精子在体内的存活率下降，从而使精子畸形率增加;

4、唇腭裂：如果存在唇腭裂，可能会导致语言器官发育不良或者畸形，就可能会导致精子畸形率增加，还可能会引起听力障碍;

5、大脑异常：大脑异常也可能会影响精子质量，如果大脑存在异常，可能会导致精子的认知能力下降或者影响精子的运动能力，从而使精子畸形率增加。

因此，建议男性在备孕期间，保持营养均衡摄入，避免抽烟、喝酒、熬夜等不良生活习惯。如果怀孕后存在胎儿畸形的情况，需要及时就医进行检查，通常可以通过染色体检查等方式进行判断。