怀孕有习惯性流产，可能与染色体异常、内分泌异常、免疫系统疾病、抗磷脂综合征、子宫发育异常等原因有关，明确原因后可通过一般治疗、药物治疗、手术治疗等措施进行处理。

1、一般治疗：如果是由于染色体异常、内分泌异常等原因导致，对于有习惯性流产史者，医生会建议做染色体检查，以明确是否存在染色体异常。另外，孕期还应注意休息，避免熬夜、劳累，适量补充优质蛋白、钙质等营养物质，保持营养均衡;

2、药物治疗：若怀孕有习惯性流产，伴有感染时，可在医生指导下用药物治疗，如阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等，同时也可遵医嘱使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片等保胎治疗。如果存在甲状腺功能减退，建议遵医嘱使用左甲状腺素钠片治疗;

3、手术治疗：若怀孕有习惯性流产，可能与子宫畸形、宫腔粘连等因素有关，可在医生的指导下行手术治疗，比如宫腔镜下宫腔粘连分离术等;

4、其他治疗：若女性是由于免疫系统疾病或抗磷脂综合征等抗磷脂综合征引起的怀孕有习惯性流产，可遵医嘱使用注射用阿磷酸钠、硫酸羟氯喹片等药物进行治疗。如果是由于子宫发育异常引起的怀孕有习惯性流产，可遵医嘱通过宫颈环扎术等手术治疗。

若出现怀孕有习惯性流产的情况，建议及时到医院妇产科就诊，完善血常规检查、肝功能检查、肾功能检查、凝血功能检查、甲状腺功能检查等明确具体情况，并积极配合医生治疗。